A laboratóriumi mintafeldolgozás egyik legkritikusabb elemének számít a precíz mintajelölés. Egyetlen elveszett vagy azonosíthatatlan minta is jelentős többletmunkát eredményezhet. Azonban, míg egyes csöveket könnyű felcímkézni, a PCR-csövek címkézése komoly kihívást jelent a kutatók számára. Ebben a blogban a PCR-csövek jelölésével kapcsolatos nehézségekre világítunk rá, és hatékony megoldásokat kínálunk.
A PCR, vagyis polimeráz láncreakció az egyik leggyakrabban végzett laboratóriumi eljárás, számos alapkutatás és diagnosztikai eljárás szerves részét képezi. A technológia rohamos fejlődése mellett a kutatók számára azonban továbbra is az egyik legnagyobb kihívást jelenti a PCR-csövek tartós, információgazdag jelölésének problémája. Ezen kisméretű kupakos csöveken csupán néhány milliméter hely áll rendelkezésre, kevés az írható, ragasztható felület.
Az egyes PCR-csövek feliratozására két lehetséges módon történhet: a cső oldalára vagy a kupakjára. Mivel a felragaszható címkék általában túl nagyok a PCR-csövekhez, sokan úgy döntenek, hogy közvetlenül a cső kupakjára írnak ultravékony hegyű filctollal. Ez talán a legköltséghatékonyabb, hagyományos módszer, de sokszor olvashatatlanná válik az írás, könnyen elkenődik egy PCR reakciót követően.
Mások egyszerűen színkóddal látják el a csöveket, vagy soronként csak egy csövet címkéznek fel, ami nagy odafigyelést precizitást kíván a PCR munka során.
Különböző gyártók változatos módon nyújtanak megoldást, melyek közül néhányat bemutatunk a teljesség igény nélkül.
A LabTAG ® komplett PCR-megoldásokat kínál, amelyek címkék, és színes címkejelölők széles választékából állnak, lehetővé teszik a 0,2 ml-es PCR-csövek, a nagy profilú 8-lyukú PCR-csíkok, valamint a szoknyás, félig szegélyezett és nem szegélyezett PCR tálcák egyszerű címkézését is, így a lemezeket egyértelműen azonosítani lehet a PCR-reakció előtt, alatt és után.
Egy másik újszerű technológia a rádiófrekvenciás (RFID) azonosítás, mely egy hatékony eszköz a nyilvántartások vezetésére, hozzáférés-ellenőrzésre, leltárkövetésre, minta- és betegkezelésre és még sok másra. A rugalmas NFC-, HF- és UHF-betétekkel ellátott címkék lehetővé teszik a különböző felületekre történő felhelyezést, de az egyedi igények szerint testreszabható RFID-címkék készítése is megoldható. Ez a technológia sokkal hatékonyabb nagyobb mintaszám esetén, de költségigénye miatt sokan megfontolják a bevezetését.
Az Azenta Life Sciences új Cap2 TM csőkollekciója inovatív 0,2 ml-es PCR mikrocentrifuga csöveket tartalmaz. Ezek a csövek dupla kupakkal, csuklós fedéllel és csavaros kupakkal rendelkeznek, hogy megőrizzék a genetikai vizsgálatokban használt minták integritását. A Cap 2 csövek segítségével minimalizálható a mintaátvitel során jelentkező probléma, így több hatékonyság érhető el és kevesebb pazarlás történik.
Ezek a csövek lehetővé teszik a minták teljes nyomon követhetőségét a széles körű genetikai vizsgálatok során, ideértve a preimplantációs genetikai vizsgálatokat is (PGT). Minden Cap 2 cső rendelkezik egyedi 2D adatmátrix kóddal és numerikus, ember által olvasható azonosítóval, hogy elkerüljük a mintakövetési hibákat.
Hogyan kerülhetjük el leginkább az emberi tévedés kockázatát? Természetesen automatizálással – lehet a válasz. Egy ilyen hatékony eszköz beszerzése erősen ajánlott a biobankok számára gyűjtött minták esetében. Itt sokszor szélsőséges körülmények között, folyékony nitrogénben tárolt mintákat is biztonsággal meg kell találnunk évek múlva.
A Tubewriter berendezések tartós, UV sugárzásra keményedő technológiát használnak, kisebb jobban olvasható betűtípusok és vonalkódok nyomtathatók, ami hosszú idő elteltével is lehetővé teszi az automatizált és a manuális leolvasást is. Könnyen csatlakoztatható a megszokott excel tábláinkhoz, nagyszerűen adaptálható szinte az összes csőtípushoz, amit a laboratóriumunkban használunk.
A megfelelő jelölési módszer használatával könnyen elkerülhetjük a minták keveredését. Letővé válik a könnyű azonosítás és nyomonkövetés. Lehetőséget kapunk, hogy fontos adatokat rögzítsünk a csöveken – mint például a minta neve, időpont, illetve fontos kísérleti paraméterek. A helyesen jelölt címkék minimalizálják a kockázatot. Az egyértelműen jelölt csövek kiküszöbölik az esetleges tévedéseket, amelyek a mérés hibáihoz vagy kereszt-kontaminációhoz vezethetnek. Megfelelő címkézéssel könnyen nyomon követhető, hogy melyik minta milyen műveleti lépéseken ment keresztül. Ez fontos információ lehet a kísérlet reprodukálhatósága és eredményeinek értelmezése szempontjából.
